桂松涛.
学历: 博士(遗传学) 出生年月: 1991年1月 籍贯:山东临沂 政治身份:中共党员
通讯地址: 山东省 泰安市 泰山区 岱宗大街61号 （271018）
联系方式
研究方向
作物群体遗传学、泛基因组和图形基因组;
结合多组学数据解析作物复杂表型变异的遗传基础;
开发作物多组学分析相关工具和数据库;
科研技能
编程语言: Bash; Perl; R; Julia; Python(Read&Edit); Rust(Trying);
操作系统: Linux(Debian, Ubuntu, Red Hat); Windows; HPC cluster(CentOS7-based)
生物信息相关:
主流测序/组学分析流程: 熟悉二代/三代DNA/RNA测序分析流程, 以及各种延伸组学测序分析(ATAC-seq, ChIP-seq)等;
常规生物信息分析技术:
群体遗传学: 遗传变异鉴定(SNP/INDEL/SV), 遗传图谱构建, 群体选择, 关联/连锁分析等;
进化生物学: 多序列比对, 系统发生树构建, 选择进化分析等;
基因组学: 基因组组装/注释, 比较基因组分析等;
统计分析: 熟练运用降维, 聚类, 富集, 假设检验等常规统计方法回答科学问题, 正在学习线性回归, 贝叶斯统计相关知识;
数据可视化: 熟练运用R/ggplot, Julia/Makie, AdobeIllustrator, Photoshop等工具画图;
按需开发流程: 已开发泛基因组构建流程, 基于WGS的SV鉴定流程, GWAS下游分析流程等
Web开发相关: 曾设计复杂生物数据库网站, 了解前后端架构;
生物学相关:
进化 > 功能: 更习惯基于多组学数据, 以从宏观切入并逐步细化的方式回答科学问题;
理论 > 实验: 长期从事数据分析工作, 更擅长基础理论研究, 期待与擅长实验的团队合作;
科研经历
校聘教授
山东农业大学 生命科学学院
基于泛基因组和多组学整合的作物改良;
小麦基因组和群体遗传学
博士后
华中农业大学 作物遗传改良全国重点实验室; 合作老师: 严建兵 教授
玉蜀黍属泛基因组的构建及其在玉米遗传育种中的应用;
基于玉米群体各种遗传变异研究玉米表型变异的遗传基础;
构建玉米多组学数据库 Zeamap
博士研究生
武汉大学 杂交水稻全国重点实验室; 导师: 丁毅 教授
中国莲(Nelumbo nucifera)高密度遗传图谱的构建;
中国莲比较基因组和基部双子叶植物的进化研究;
中国莲细胞器基因组的构建和进化分析(参与);
中国莲着丝粒组蛋白和着丝粒进化分析(参与);
水稻种质DNA指纹图谱的鉴定(参与);
兴趣 & 教育经历
兴趣
- 群体遗传学
- 图形基因组
- Julia编程
- 乒乓球
- 猫
教育经历
-
博士后(作物遗传育种), 2018-今
华中农业大学
-
博士(遗传学), 2012-2017
武汉大学
-
学士(生物科学), 2008-2012
山东师范大学
资助 & 奖励
2021-2023, 国家自然科学基金青年基金, 32000396, 主持
2022, 湖北省博士后创新创业大赛, 优胜奖
2020, 第一届全国作物学科博士后论坛, 优秀报告奖;
2019-2021, 华中农业大学 植物科学与技术学院, 优秀博士后资助;
2017, 第七届湖北植物生物学大会, 优秀报告一等奖;
2016, 全国植物生物学大会, 优秀墙报三等奖;
2016, 武汉大学, 博士研究生国家奖学金;
发表文章
#: 共同一作;*: 通讯作者
